En 2008, lors du lancement de l'App Store pour iOS, Apple avait fait une demande auprès de U.S. Patent and Trademark Office (organisme américain chargé du dépôt de marques) dans le but de déposer la marque "App Store". Cette requête fait aujourd'hui l'objet d'un début de bataille entre Apple et Microsoft.

En effet, cette dernière s'oppose au dépôt de la marque "App Store", arguant qu'elle serait composée de deux termes trop génériques, et trop largement utilisés sur le secteur des applications mobiles. En effet, de nombreux magasins concurrents à l'App Store existent, notamment l'Android Market, l'Ovi Store ou encore le Windows Phone 7 Marketplace.

Microsoft appuie d'ailleurs son argumentation en citant des propos de Steve Jobs, employant le terme "App Store" pour qualifier les plateformes de distribution d'applications de ses principaux concurrents.

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